Este majestuoso templo está ubicado al sur este de la plaza de armas y rodeado de los jirones Puga, Dos de Mayo, Amazonas y Belén.

En el año 1562 este convento fue concluido y aquí vivieron los primeros franciscanos.

El mas celebre de ellos fue Mateo de Jumila quién a pesar de no ser sacerdote fue el que evangeliza a Cajamarca y Chachapoyas.

Este convento en el año 1811 por orden del virrey Abacal se convierte en parroquia y los franciscanos tuvieron que dejar el convento.

En el año 1870 a petición de los cajamarquinos los franciscanos regresan al vivir en el convento hasta el día de hoy.

Este hermoso templo se comenzó a construir en 1699.

Para la construcción del templo se emplearon piedras labradas que se extrajeron del cerro Santa Apolonia.

El convento de San francisco fue diseñada por el arquitecto Matías Pérez Palomino y su construcción duro hasta el siglo XVIII.

La fachada del convento tiene 3 puertas que son la entrada al templo, el estilo de las columnas del convento son de barroco plateresca.

En medio en un nicho principal se haya la estatuilla de San Antonio de Padua.

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